予約した健康診断の検査項目に不足がありました。別の医療機関で不足項目の検査を受け、健康診断書を2枚提出しても問題ないですか。

既に予約しておられる病院で不足項目を追加で検査することが出来ないか、まずは医療機関にお問い合わせください。
可能な限り、健康診断書は1枚であることが望まれます。どうしても難しい場合に限り、複数枚の健康診断書を受け付けます。
その場合、どちらかの健康診断書の余白に2つの病院で受診することになった理由を記載して、提出してください。